Limfotoksin beta receptor

Iz Wikipedije, slobodne enciklopedije
Idi na navigaciju Idi na pretragu
edit
Limfotoksin beta receptor (TNFR superfamilija, član 3)

Kristalografska struktura peptida sa 24 ostatka iz limfotoksin-B receptora vezanog za TRAF3.[1]
Dostupne strukture
1RF3
Identifikatori
SimboliLTBR; CD18; D12S370; LT-BETA-R; TNF-R-III; TNFCR; TNFR-RP; TNFR2-RP; TNFRSF3
Vanjski IDOMIM600979 MGI104875 HomoloGene1753 GeneCards: LTBR Gene
Pregled RNK izražavanja
PBB GE LTBR 203005 at tn.png
podaci
Ortolozi
VrstaČovekMiš
Entrez405517000
EnsemblENSG00000111321n/a
UniProtP36941n/a
RefSeq (mRNA)NM_002342XM_982227
RefSeq (protein)NP_002333XP_987321
Lokacija (UCSC)Chr 12:
6.36 - 6.37 Mb
n/a
PubMed pretraga[1][2]

Limfotoksin beta receptor je receptor za limfotoksin koji je kod ljudi kodiran LTBR genom.[2][3][4]

Funkcija[uredi - уреди | uredi izvor]

Protein kodiran ovim genom je član TNF familije receptora. On je izražen na površini većine ćelijskih tipova, uključujući ćelije epitelnog i mijeloidnog porekla, ali ne na T i B limfocitima. Ovaj protein specifično vezuje limfotoksin membransku formu (kompleks limfotoksina-alfa i limftoksina-beta se formira). Limftoksin-beta i njegov ligand učestvuju u razvoju i organizaciji limfoidnog tkiva. Aktivacija ovog proteina može da podstakne apoptozu.[2]

Ne samp da LTBR pomaže u podsticanju apoptoze, on može da dovede do oslobađanja citokina interleukin 8. Prekomerno LTBR izražavanje u HEK293 ćelima povećava IL-8 promotorsku aktivnost, i dovodi do IL-8 oslobađanja. LTBR je takođe esencijalan za razvoj i organizaciju sekundarnih limfoidnih organa i oslobađanje drugih hemokina.[5]

Struktura[uredi - уреди | uredi izvor]

Ramačandranov dijagram pokazuje da je 64.6% ostataka u poželjnom regionu.[6] Ova structura je ustanovljena putem difrakcije X-zraka. Njena rezolucija je 3.50 Å. Alfa i beta uglovi su 90 stepeni, dok je gama ugao 120 stepeni.

Interakcije[uredi - уреди | uredi izvor]

Za limfotoksin beta receptor je bilo pokazano da interaguje sa Dijablo homologom[7] i TRAF3.[8][9][10]

Reference[uredi - уреди | uredi izvor]

  1. PDB 1RF3; Li C, Norris PS, Ni CZ, Havert ML, Chiong EM, Tran BR, Cabezas E, Reed JC, Satterthwait AC, Ware CF, Ely KR (December 2003). "Structurally distinct recognition motifs in lymphotoxin-beta receptor and CD40 for tumor necrosis factor receptor-associated factor (TRAF)-mediated signaling". J. Biol. Chem. 278 (50): 50523–9. PMID 14517219. doi:10.1074/jbc.M309381200. 
  2. 2,0 2,1 "Entrez Gene: LTBR lymphotoxin beta receptor (TNFR superfamily, member 3)". http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?Db=gene&Cmd=ShowDetailView&TermToSearch=4055. 
  3. Baens M, Chaffanet M, Cassiman JJ, van den Berghe H, Marynen P (April 1993). "Construction and evaluation of a hncDNA library of human 12p transcribed sequences derived from a somatic cell hybrid". Genomics 16 (1): 214–8. PMID 8486360. doi:10.1006/geno.1993.1161. 
  4. Crowe PD, VanArsdale TL, Walter BN, Ware CF, Hession C, Ehrenfels B, Browning JL, Din WS, Goodwin RG, Smith CA (April 1994). "A lymphotoxin-beta-specific receptor". Science (journal) 264 (5159): 707–10. PMID 8171323. doi:10.1126/science.8171323. 
  5. Chang YH, Hsieh SL, Chen MC, Lin WW (August 2002). "Lymphotoxin beta receptor induces interleukin 8 gene expression via NF-kappaB and AP-1 activation". Exp. Cell Res. 278 (2): 166–74. PMID 12169272. doi:10.1006/excr.2002.5573. 
  6. "MolProbity Ramachandran analysis". http://www.rcsb.org/pdb/images/1RF3_ram_m_500.pdf. 
  7. Kuai, Jun; Nickbarg Elliott, Wooters Joe, Qiu Yongchang, Wang Jack, Lin Lih-Ling (April 2003). "Endogenous association of TRAF2, TRAF3, cIAP1, and Smac with lymphotoxin beta receptor reveals a novel mechanism of apoptosis". J. Biol. Chem. (United States) 278 (16): 14363–9. ISSN 0021-9258. PMID 12571250. doi:10.1074/jbc.M208672200. 
  8. VanArsdale, T L; VanArsdale S L, Force W R, Walter B N, Mosialos G, Kieff E, Reed J C, Ware C F (March 1997). "Lymphotoxin-beta receptor signaling complex: role of tumor necrosis factor receptor-associated factor 3 recruitment in cell death and activation of nuclear factor kappaB". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. (UNITED STATES) 94 (6): 2460–5. ISSN 0027-8424. PMC 20110. PMID 9122217. doi:10.1073/pnas.94.6.2460. 
  9. Wu, M Y; Wang P Y, Han S H, Hsieh S L (April 1999). "The cytoplasmic domain of the lymphotoxin-beta receptor mediates cell death in HeLa cells". J. Biol. Chem. (UNITED STATES) 274 (17): 11868–73. ISSN 0021-9258. PMID 10207006. doi:10.1074/jbc.274.17.11868. 
  10. Marsters, S A; Ayres T M, Skubatch M, Gray C L, Rothe M, Ashkenazi A (May 1997). "Herpesvirus entry mediator, a member of the tumor necrosis factor receptor (TNFR) family, interacts with members of the TNFR-associated factor family and activates the transcription factors NF-kappaB and AP-1". J. Biol. Chem. (UNITED STATES) 272 (22): 14029–32. ISSN 0021-9258. PMID 9162022. doi:10.1074/jbc.272.22.14029. 

Literatura[uredi - уреди | uredi izvor]

Spoljašnje veze[uredi - уреди | uredi izvor]