Struktura E. coli helikaze RuvA
Helikaze su klasa enzima koji su vitalni za sve žive organizme . One su motorni proteini koji se kreću duž fosfodiesterske osnove nukleinske kiseline , razdvajajući dva spojena lanca (i.e., DNK , RNK , ili RNK-DNK hibrid) koristeći energiju dobijenu iz ATP hidrolize .
Mnogi ćelijski procesi (replikacija DNK , transkripcija , translacija , rekombinacija , popravka DNK , ribozomska biogeneza ) obuhvataju separaciju lanaca nukleinske kiseline. Helikaze se često koriste za razdvajanje lanaca DNK dvostrukog heliksa ili samostalno spojenih RNK molekula koristeći energiju ATP hidrolize. One se postepeno kreću duž jedne nukleinske kiseline dupleksa sa smerom i brzinom specifičnom za svaki pojedini enzim. Poznato je mnoštvo helikaza, i one proizvode znatnu raznovrsnost procesa u kojima je neophodna kataliza razdvajanja lanaca.[ 1] [ 2] [ 3]
↑ Yuliang Wu, Kazuo Shin-ya and Robert M. Brosh Jr. (2008). „FANCJ Helicase Defective in Fanconia Anemia and Breast Cancer Unwinds G-Quadruplex DNA To Defend Genomic Stability” . Mol. Cell. Biol. 28 (12): 4116-4128. DOI :10.1128/MCB.02210-07 . Arhivirano iz originala na datum 2013-05-06. Pristupljeno 2014-01-25 .
↑ Haiyong Han, Richard J. Bennett, and Laurence H. Hurley (2000). „Inhibition of Unwinding of G-Quadruplex Structures by Sgs1 Helicase in the Presence of N,N‘-Bis[2-(1-piperidino)ethyl -3,4,9,10-perylenetetracarboxylic Diimide, a G-Quadruplex-Interactive Ligand”]. Biochemistry 39 (31): 9311–9316. DOI :10.1021/bi000482r .
↑ Haiyong Han, David R. Langley, Anupama Rangan, and Laurence H. Hurley (2001). „Selective Interactions of Cationic Porphyrins with G-Quadruplex Structures” . J. Am. Chem. Soc. 123 (37): 8902–8913. DOI :10.1021/ja002179j .
hromodomenske helikaze: CHD1 , CHD1L , CHD2 , CHD3 , CHD4 , CHD5 , CHD6 , CHD7 , CHD8 , CHD9
DEAD kutija /DEAD/DEAH kutija helikaze : DDX3X , DDX5 , DDX6 , DDX10 , DDX11 , DDX12 , DDX58 , DHX8 , DHX9 , DHX37 , DHX40 , DHX58
ASCC3 , BLM , BRIP1 , DNA2 , FBXO18 , FBXO30 , HELB , HELLS , HELQ , HELZ , HFM1 , HLTF , IFIH1 , NAV2 , PIF1 , RECQL , RTEL1 , SHPRH , SMARCA4 , SMARCAL1 , WRN , WRNIP1
Separacija i inicijacija
Replikacija
DNK polimeraza III holoenzim (
dnaC ,
dnaE ,
dnaH ,
dnaN ,
dnaQ ,
dnaT ,
dnaX ,
holA ,
holB ,
holC ,
holD ,
holE )
• Replizom • DNK ligaza • DNK stega • Topoizomeraza (
DNK giraza )
Prokariotska DNK polimeraza :
DNK polimeraza I (
Klenov fragment )
Oba
Terminacija B bsyn : dnk (repl , cycl , reco , repr ) • tscr (fact , tcrg , nucl , rnat , rept , ptts ) • tltn (risu , pttl , nexn ) • dnab , rnab /runp • stru (domn , 1° , 2° , 3° , 4° )