Integraza

Iz Wikipedije, slobodne enciklopedije
Idi na navigaciju Idi na pretragu
Integrazni domen vezivanja cinka
PDB 1wjd EBI.jpg
Struktura n-terminalnog zn vezujućeg domena hiv-1 integraze (e forme), nmr, 38 struktura
Identifikatori
Simbol Integrase_Zn
Pfam PF02022
InterPro IPR003308
SCOP 1wjb
Superfamilija 1wjb
Sržni domen integraze
PDB 1c1a EBI.jpg
Kristalna struktura rsv, dvodomenske integraze
Identifikatori
Simbol rve
Pfam PF00665
Pfam klan CL0219
InterPro IPR001584
SCOP 2itg
Superfamilija 2itg
Integrazni domen vezivanja DNK
PDB 1c1a EBI.jpg
kristalna struktura rsv dvodomenske integraze
Identifikatori
Simbol IN_DBD_C
Pfam PF00552
InterPro IPR001037
SCOP 1ihw
Superfamilija 1ihw

Retrovirusna integraze (IN) enzim je koji proizvode retrovirusi (poput HIVa), koji omogućavaju da se njihov genetički materijal integriše u DNK inficirane ćelije. Retrovirusni IN enzimi se razlikuju od fagnih integraza, poput λ fagne integraze (Int).

IN je ključna komponenta retrovirusnog preintegracionog kompleksa (PIC).

Strukture[uredi - уреди | uredi izvor]

Svi retrovirusni IN proteini sadrže tri kanonička domena, povezana fleksibilnim sponama:

  • N-terminusni HH-CC zink-vezujući domen (tri-heliksni svežanj je stabilizovan koordinacijom Zn(II) katjona)
  • katalotičko sržni domen (RNazaH savijanje)
  • C-terminusni DNK-vezujući domen (SH3 motiv)[1]

Kristalne i NMR strukture individualnih domena i 2-domenski konstrakti integraza iz HIV-1, HIV-2, SIV, i Rous Sarcoma Virusa (RSV) su poznati. Prva struktura je određena 1994.

Biohemijski i strukturni podaci sugerišu da retrovirusne integraze deluju kao tetrameri (dimeri dimera). Sva tri domena su važna za multimerizaciju i vezivanje viralne DNK. Tokom ranih 2010, rešene su kristalne strukture IN iz prototipnog PFV virusa sklopljene na viralnim DNK krajevima.[2]

Vidi još[uredi - уреди | uredi izvor]

Reference[uredi - уреди | uredi izvor]

  1. Lodi PJ, Ernst JA, Kuszewski J, Hickman AB, Engelman A, Craigie R, Clore GM, Gronenborn AM (August 1995). "Solution structure of the DNA binding domain of HIV-1 integrase". Biochemistry 34 (31): 9826–33. PMID 7632683. doi:10.1021/bi00031a002. 
  2. "Scientists say crack HIV/AIDS puzzle for drugs". Reuters. January 31, 2010. 

Vanjske veze[uredi - уреди | uredi izvor]