PX domen
| |||||||||
| PX domen NADH oksidaze (p40phox) vezane za lipid | |||||||||
| Identifikatori | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Simbol | PX | ||||||||
| Pfam | PF00787 | ||||||||
| InterPro | IPR001683 | ||||||||
| SMART | PX | ||||||||
| PROSITE | PDOC50195 | ||||||||
| SCOP | 1h6h | ||||||||
| Superfamilija | 1h6h | ||||||||
| OPM protein | 60 | ||||||||
| OPM protein | 1xte | ||||||||
| CDD | cd06093 | ||||||||
| |||||||||
PX domen je strukturni domen koji vezuje fosfoinozitid i učestvuje u sortiranju proteina ka ćelijskoj membrani.
Ovaj domen je prvo bio otkriven u P40phox i p47phox domenima NADPH oksidaza (phox označava fagocitnu oksidazu).[1][2] On je takođe identifikovan u mnogim drugim proteinima koji učestvuju u membranskoj razmeni, uključujući neksine, fosfolipazu D, i fosfoinozitid-3-kinaze.
PX domen je strukturno konzerviran kod eukariota, mada aminokiselinske sekvence imaju malu sličnost.[3] PX domeni prvenstveno formiraju interakcije sa PtdIns(3)P lipidima.[4][5] Neki od njih se vezuju za fosfatidnu kiselinu, PtdIns(3,4)P2, PtdIns(3,5)P2, PtdIns(4,5)P2, i PtdIns(3,4,5)P3. PX-domen takođe može da formira interakcije sa drugim domenima i proteinima.
Sortirajući neksini sadrže ovaj domen. Drugi primeri su:
- HS1BP3
- KIF16B (SNX23)
- NCF1; NCF1C; NCF4; NISCH
- PIK3C2A; PIK3C2B; PIK3C2G; PLD1; PLD2; PXK
- RPS6KC1
- SGK3; SH3PXD2A; SNAG1
- ↑ Ponting CP (November 1996). „Novel domains in NADPH oxidase subunits, sorting nexins, and PtdIns 3-kinases: binding partners of SH3 domains?”. Protein Sci. 5 (11): 2353–7. DOI:10.1002/pro.5560051122. PMC 2143296. PMID 8931154.
- ↑ Wishart MJ, Taylor GS, Dixon JE (June 2001). „Phoxy lipids: revealing PX domains as phosphoinositide binding modules”. Cell 105 (7): 817–20. DOI:10.1016/S0092-8674(01)00414-7. PMID 11439176.
- ↑ Hiroaki H, Ago T, Ito T, Sumimoto H, Kohda D (June 2001). „Solution structure of the PX domain, a target of the SH3 domain”. Nat. Struct. Biol. 8 (6): 526–30. DOI:10.1038/88591. PMID 11373621.
- ↑ Karathanassis D, Stahelin RV, Bravo J, Perisic O, Pacold CM, Cho W, Williams RL (October 2002). „Binding of the PX domain of p47phox to phosphatidylinositol 3,4-bisphosphate and phosphatidic acid is masked by an intramolecular interaction”. EMBO J. 21 (19): 5057–68. DOI:10.1093/emboj/cdf519. PMC 129041. PMID 12356722.
- ↑ Ago T, Kuribayashi F, Hiroaki H, Takeya R, Ito T, Kohda D, Sumimoto H (April 2003). „Phosphorylation of p47phox directs phox homology domain from SH3 domain toward phosphoinositides, leading to phagocyte NADPH oxidase activation”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100 (8): 4474–9. DOI:10.1073/pnas.0735712100. PMC 153580. PMID 12672956.