PAS domen
Prijeđi na navigaciju
Prijeđi na pretragu
| |||||||||
| Struktura PAS domena bakterijskog senzora kiseonika fixL.[1] Protein je prikazan u trakastoj notaciji u bojama duge (N-terminus = plavo, C-terminus = crveno. Hem ligand je u sredini (ugljenik = belo, azot = plavo, kiseonik = crveno, gvožđe = naradžasto). | |||||||||
| Identifikatori | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Simbol | PAS | ||||||||
| Pfam | PF00989 | ||||||||
| InterPro | IPR013767 | ||||||||
| SMART | PAS | ||||||||
| PROSITE | PDOC50112 | ||||||||
| SCOP | 2phy | ||||||||
| Superfamilija | 2phy | ||||||||
| |||||||||
PAS domen je proteinski domen koji je sadržan u mnogim signalnim proteinima gde funkcioniše kao senzor signalna.[2][3] PAS domeni su prisutni u velikom broju organizama od bakterija do ljudi. PAS domen je imenovan koristeći početna slova tri proteina:
- Per – Protein cirkadijanskog perioda
- Arnt – Nuklearni transporter arilnog ugljovodoničnog receptora
- Sim – SIM1
Mnogi proteini sa PAS domenom detektuju signal putem asocijacije sa kofaktorom, kao što je hem.[4] Proteini koji sadrže PAS domen obuhvataju induktivne faktore hipoksije.
Reference[uredi | uredi kod]
- ↑ PDB 1y28; Dunham CM, Dioum EM, Tuckerman JR, Gonzalez G, Scott WG, Gilles-Gonzalez MA (July 2003). „A distal arginine in oxygen-sensing heme-PAS domains is essential to ligand binding, signal transduction, and structure”. Biochemistry 42 (25): 7701–8. DOI:10.1021/bi0343370. PMID 12820879.
- ↑ Ponting CP, Aravind L (November 1997). „PAS: a multi-functional domain family comes to light”. Curr. Biol. 7 (11): R674–7. DOI:10.1016/S0960-9822(06)00352-6. PMID 9382818.
- ↑ Hefti MH, Françoijs KJ, de Vries SC, Dixon R, Vervoort J (March 2004). „The PAS fold. A redefinition of the PAS domain based upon structural prediction”. Eur. J. Biochem. 271 (6): 1198–208. DOI:10.1111/j.1432-1033.2004.04023.x. PMID 15009198.
- ↑ Gilles-Gonzalez MA, Gonzalez G (February 2004). „Signal transduction by heme-containing PAS-domain proteins”. J. Appl. Physiol. 96 (2): 774–83. DOI:10.1152/japplphysiol.00941.2003. PMID 14715687.