Leucinski zatvarač – razlika između verzija – Wikipedija / Википедија

„Pogled od gore“, ili dijagram heliksnog točka, leucinskog zatvarača, gde d označava aminokiselinu leucin, razmeštenu sa drugim aminokiselinama na dva paralelna alfa heliksa.

Leucinski zatvarač (leucinski patentni zatvarač, leucinske makaze)^[1] je čest trodimenzioni strukturni motiv proteina. Ovi motivi se obično sreću kao deo DNK-vezujućeg domena kod raznih transkripcionih faktora, i stoga učestvuju u regulaciji ekspresije gena. Leucinski zatvarači su prisutni kod eukariotskih i prokariotskih regulatornih proteina, mada su oni prvenstveno svojstveni za eukariote.

Leucinksi zatvarač je super-sekundarna struktura koja funkcioniše kao dimerizacioni domen, i njeno prisustvo generiše adhezione sile između paralelnih alfa heliksa.^[2] Leucinski zatvarač se sastoji od više leucinskih ostataka na aproksimativno 7-ostataka dugim intervalima, čime se formira amfipatični alfa heliks sa hidrofobinim regionom duž jedne strane. Taj hidrofobni region omogućava dimerizaciju, ili zatvaranje motiva. Hidrofobni leucinski region je apsolutno neophodan za DNK vezivanje.

Reference

↑ David M. Glick, ur. (1997). „Leucine scissors”. Glossary of Biochemistry and Molecular Biology (Revised izd.). London: Portland Press.
↑ Landschulz WH, Johnson PF, McKnight SL (24. 06. 1988.). „The leucine zipper: a hypothetical structure common to a new class of DNA-binding proteins”. Science 240 (4860): 1759–1764. DOI:10.1126/science.3289117. PMID 3289117.

Spoljašnje veze

MeSH Leucine+zippers

Transkripcioni faktori i intracelularni receptori

(1) Osnovni domeni

(1.1) Osnovni leucin rajsferšlus (bZIP)	Aktivirajući transkripcioni faktor (AATF, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7) • AP-1 (c-Fos, FOSB, FOSL1, FOSL2, c-Jun, JUNB, JUND) • BACH (1, 2) • BATF • BLZF1 • C/EBP (α, β, γ, δ, ε, ζ) • CREB (1, 3, L1) • CREM • DBP • DDIT3 • GABPA • HLF • MAF (B, F, G, K) • NFE (2, L1, L2) • NFIL3 • NRL • NRF1 • XBP1
(1.2) Osnovni heliks-petlja-heliks (bHLH)	ATOH1 • AhR • AHRR • ARNT • ASCL1 • BHLHB2 • BMAL (ARNTL, ARNTL2) • CLOCK • EPAS1 • HAND (1, 2) • HES (5, 6) • HEY (1, 2, L) • HES1 • HIF (1A, 3A) • ID (1, 2, 3, 4) • LYL1 • MXD4 • MYCL1 • MYCN • Myogenic regulatorni faktori (MyoD, Myogenin, MYF5, MYF6) • Neurogenini (1, 2, 3) • NeuroD (1, 2) • NPAS (1, 2, 3) • OLIG (1, 2) • Pho4 • Scleraxis • TAL (1, 2) • Twist • USF1
(1.3) bHLH-ZIP	AP-4 • MAX • MITF • MNT • MLX • MXI1 • Myc • SREBP (1, 2)
(1.4) NF-1	NFI (A, B, C, X) • SMAD (R-SMAD (1, 2, 3, 5, 9) - I-SMAD (6, 7) - 4)
(1.5) RF-X	RFX (1, 2, 3, 4, 5, ANK)
(1.6) Osnovni heliks-razmak-heliks (bHSH)	AP-2 (α, β, γ, δ, ε)

(2) Cink prst DNA-vezujući domeni

(2.1) Nuklearni receptor (Cys₄)	podfamilija 1 (Tiroidni hormon (α, β), CAR, FXR, LXR (α, β), PPAR (α, β/δ, γ), PXR, RAR (α, β, γ), ROR (α, β, γ), Rev-ErbA (α, β), VDR) podfamilija 2 (COUP-TF (I, II), Ear-2, HNF4 (α, γ), PNR, RXR (α, β, γ), Testikularni receptor (2, 4), TLX) podfamilija 3 (Steroidni hormon (Androgen, Estrogen (α, β), Glukokortikoid, Mineralokortikoid, Progesteron), Estrogen-vezani (α, β, γ)) podfamilija 4 NUR (NGFIB, NOR1, NURR1) • podfamilija 5 (LRH-1, SF1) • podfamilija 6 (GCNF) • podfamilija 0 (DAX1, SHP)
(2.2) Drugi Cys₄	GATA (1, 2, 3, 4, 5, 6) • MTA (1, 2, 3) • TRPS1
(2.3) Cys₂His₂	Generalni transkripcioni faktori (TFIIA, TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF (1, 2), TFIIH (1, 2, 4, 2I, 3A, 3C1, 3C2)) ATBF1 • BCL (6, 11A, 11B) • CTCF • E4F1 • EGR (2, 3) • ERV3 • GFI1 • GLI-Kruppel familija (1, 2, 3, REST, S2, YY1) • HIC (1, 2) • HIVEP (1, 2, 3) • IKZF (1, 2, 3) • ILF (2, 3) • KLF (2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 17) • MTF1 • MYT1 • OSR1 • SP (1, 2, 4, 7) • WT1 • Zbtb7 (7A, 7B) • ZBTB (16, 17, 20, 32, 33, 40) • cink prst (3, 7, 9, 10, 19, 22, 24, 33B, 34, 35, 41, 43, 44, 51, 74, 143, 146, 148, 165, 202, 217, 219, 238, 239, 259, 267, 268, 281, 295, 318, 330, 346, 350, 365, 366, 384, 423, 451, 452, 471, 593, 638, 649, 655)
(2.4) Cys₆	HIVEP1
(2.5) Naizmenična kompozicija	AIRE • DIDO1 • GRLF1 • ING (1, 2, 4) • JARID (1A, 1B, 1C, 1D, 2) • JMJD1B

(3) Heliks-zavoj-heliks domeni

(3.1) Homeodomen	ARX • CDX (1, 2) • CRX • CUTL1 • DBX (1, 2) • DLX (3, 4, 5) • EMX2 • EN (1, 2) • FHL (1, 2, 3) • HESX1 • HHEX • HLX • Homeobox (A1, A2, A3, A4, A5, A7, A9, A10, A11, A13, B1, B2, B3, B4, B5, B6, B7, B8, B9, B13, C4, C5, C6, C8, C9, C10, C11, C13, D1, D3, D4, D8, D9, D10, D11, D12, D13) • HOPX • IRX (1, 2, 3, 4, 5, 6, MKX) • LMX (1A, 1B) • MEIS (1, 2) • MEOX2 • MNX1 • MSX (1, 2) • NANOG • NKX (2-1, 2-2, 2-3, 2-5, 3-1, 3-2, 6-1, 6-2) • PBX (1, 2, 3) • PHF (1, 3, 6, 8, 10, 16, 17, 20, 21A) • PITX (1, 2, 3) • POU domen (PIT-1, BRN-3: A, B, C, Oktamer transkripcioni faktor: 1, 2, 3/4, 6, 7, 11) • OTX (1, 2) • PDX1 • ZEB (1, 2)
(3.2) Paired box	PAX (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9)
(3.3) Fork glava / winged heliks	E2F (1, 2, 3, 4, 5) • FOX proteini (C1, C2, D3, E1, G1, H1, K2, L2, M1, N3, O1, O3, O4, P1, P2, P3)
(3.4) Faktori toplotnog šoka	HSF (1, 2, 4)
(3.5) Triptofan klasteri	ELF (2, 4, 5) • EGF • ELK (1, 3, 4) • ERF • ERG • ETS (1, 2, SPIB) • ETV (1, 4, 5, 6) • FLI1 • Interferon regulatorni faktori (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8) • MYB • MYBL2
(3.6) TEA domen	transkripcioni pojačivač faktor (1, 2, 3, 4)

(4) β-Scaffold faktori sa manjim žljebnim kontaktima

(4.1) Rel homologni region	NF-κB (NFKB1, NFKB2, REL, RELA, RELB) • NFAT (C1, C2, C3, C4, 5)
(4.2) STAT	STAT (1, 2, 3, 4, 5, 6)
(4.3) p53	p53 • TBX (1, 2, 3, 5, 19, 21, 22, Brahiuri, TBR1)
(4.4) MADS kutija	Mef2 (A, B, C, D) • SRF
(4.6) TATA vezujući proteini	TBP • TBPL1
(4.7) Grupa visoke pokretljivosti	HMGB (1, 2, 3) • HNF (1A, 1B) • LEF1 • SOX (1, 2, 3, 4, 5, 6, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 18, 21) • SRY • SSRP1 • TCF (3, 4) • TOX (1, 2, 3, 4)
(4.10) Domen hladnog šoka	CSDA, YBX1
(4.11) Runt	CBF (CBFA2T2, CBFA2T3, RUNX1, RUNX2, RUNX3, RUNX1T1)

(0) Drugi transkripcioni faktori

(0.2) HMGI(Y)	HMGA (1, 2) • HBP1
(0.3) Džep domen	Rb • RBL1 • RBL2
(0.5) AP-2/EREBP-vezani faktori	Apetala 2 • EREBP • B3
(0.6) Razno	ARID (1A, 1B, 2, 3A, 3B, 4A) • CAP • IFI (16, 35) • MLL (2, 3, T1) • MNDA • NFY (A, B, C) • Ro/Sigma

vidi isto transkripcioni faktor/koregulator nedostataka

@@ Red 18: / Red 18: @@
 [[Kategorija:Proteinski strukturni motivi]]
 [[Kategorija:DNK vezujuće supstance]]
-[[de:Leucin-Zipper]]
-[[en:Leucine zipper]]
-[[es:Cremallera de leucina]]
-[[ja:ロイシンジッパー]]
-[[ru:Leйcinovaя zastёžka-molniя]]
-[[sl:Levcinska zadrga]]

Leucinski zatvarač – razlika između verzija

Verzija na datum 16 maj 2014 u 21:23

Reference

Spoljašnje veze

Navigacija

Leucinski zatvarač – razlika između verzija

Verzija na datum 16 maj 2014 u 21:23

Reference

Spoljašnje veze

Navigacija

Pretraga