Ramnogalakturonanska eksolijaza
(Preusmjereno sa stranice Rhamnogalacturonan exolyase)
| Ramnogalakturonanska eksolijaza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatori | |||||||||
| EC broj | 4.2.2.24 | ||||||||
| IntEnz | IntEnz view | ||||||||
| BRENDA | BRENDA entry | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme view | ||||||||
| KEGG | KEGG entry | ||||||||
| MetaCyc | metabolic pathway | ||||||||
| PRIAM | profile | ||||||||
| PDB | RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum | ||||||||
| |||||||||
Ramnogalakturonanska eksolijaza (EC 4.2.2.24, YesX) je enzim sa sistematskim imenom alfa-L-ramnopiranozil-(1->4)-alfa-D-galaktopiranoziluronat eksolijaza.[1][2] Ovaj enzim katalizuje sledeću hemijsku reakciju
- Eksotipno eliminativno razlaganje alfa-L-ramnopiranozil-(1->4)-alfa-D-galaktopiranoziluronsko kiselinskih veza ramnogalakturonan I oligosaharida koji sadrže alfa-L-ramnopiranozu na redukujućem kraju i 4-dezoksi-4,5-nezasićenu D-galaktopiranoziluronsku kiselinu na neredukujućem kraju. Produkti su disaharid 2-O-(4-dezoksi-beta-L-treo-heks-4-enopiranuronozil)-alfa-L-ramnopiranoza i skraćeni ramnogalakturonanski oligosaharid koji sadrži 4-dezoksi-4,5-nezasićenu D-galaktopiranoziluronsku kiselinu na neredukujućem kraju.
Ovaj enzim učestvuje u degradaciji ramnogalakturonana I kod Bacillus subtilis vrste 168.
Reference[uredi | uredi kod]
- ↑ Ochiai, A., Itoh, T., Mikami, B., Hashimoto, W. and Murata, K. (2009). „Structural determinants responsible for substrate recognition and mode of action in family 11 polysaccharide lyases”. J. Biol. Chem. 284: 10181-10189. PMID 19193638.
- ↑ Ochiai, A., Itoh, T., Kawamata, A., Hashimoto, W. and Murata, K. (2007). „Plant cell wall degradation by saprophytic Bacillus subtilis strains: gene clusters responsible for rhamnogalacturonan depolymerization”. Appl. Environ. Microbiol. 73: 3803-3813. PMID 17449691.
Literatura[uredi | uredi kod]
- Nicholas C. Price, Lewis Stevens (1999). Fundamentals of Enzymology: The Cell and Molecular Biology of Catalytic Proteins (Third izd.). USA: Oxford University Press. ISBN 019850229X.
- Eric J. Toone (2006). Advances in Enzymology and Related Areas of Molecular Biology, Protein Evolution (Volume 75 izd.). Wiley-Interscience. ISBN 0471205036.
- Branden C, Tooze J.. Introduction to Protein Structure. New York, NY: Garland Publishing. ISBN: 0-8153-2305-0.
- Irwin H. Segel. Enzyme Kinetics: Behavior and Analysis of Rapid Equilibrium and Steady-State Enzyme Systems (Book 44 izd.). Wiley Classics Library. ISBN 0471303097.
- Robert A. Copeland (2013). Evaluation of Enzyme Inhibitors in Drug Discovery: A Guide for Medicinal Chemists and Pharmacologists (2nd izd.). Wiley-Interscience. ISBN 111848813X.
- Gerhard Michal, Dietmar Schomburg (2012). Biochemical Pathways: An Atlas of Biochemistry and Molecular Biology (2nd izd.). Wiley. ISBN 0470146842.