Proteinske metode

Iz Wikipedije, slobodne enciklopedije
Idi na navigaciju Idi na pretragu

Protein metode su tehnike koje se koriste za studiranje proteina.

Postoji niz eksperimentalnih metoda za studiranje proteina, npr. za detektovanje proteina, za izolovanje i prečišćavanje proteina i druge metode za karakterisanje strukture i funkcije proteina. Za primenu ovih metoda često je neophodno da se prvo prečisti protein. Računarske metode tipično koriste kompjuterske programe za analizu proteina. Mnoge eksperimentalne metode koriste kompjutersku analizu obradu sirovih podataka (npr. masena spektrometrija).

Genetičke metode

Eksperimentalna analiza proteina tipično počinje izražavanjem i prečišćavanjem proteina. Izražavanje se ostvaruje manipulusanjem DNK koja kodira protein(e) od interesa. Iz tog razloga za proteinska analizu su obično neophodne DNK metode, posebno kloniranje. Drugi primeri su

  • konceptualna translacija - mnogi proteini nikad nisu bili direktno sekvencirani, ali su njihove aminokiselinske sekvence poznate putem "konceptualne translacije" poznate iRNK sekvence.
  • mutageneza usmerena na položaj omogućava formiranje i testiranje novih varijanti proteina radu određivanja uticaja strukturnih promena na funkciju proteina.
  • umetanje proteinskih oznaka kao što je His oznaka. (pogledajte zeleni fluorescentni protein)
  • Proteini koji učestvuju u ljudskim bolestima se mogu identifikovati nalaženjem alela bolesti i drugih fenotipskih karakteristika koristeći metode kao što je proračun LOD bodovanja.

Detekcija proteina

Proteinsko prečišćavanje

Proteinska struktura

Protein-Protein interakcije

Protein-DNK interakcije

Računarske metode

Druge metode

Literatura[uredi - уреди | uredi izvor]

  • "Protein Methods", 2nd Edition by Daniel M. Bollag, Michael D. Rozycki and Stuart J. Edelstein (1996) Published by Wiley Publishers ISBN 0-471-11837-0.