Tioredoksinski sklop
| |||||||||
| Molekul ljudskog tioredoksina (1ERT) | |||||||||
| Identifikatori | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Simbol | Thioredoxin | ||||||||
| Pfam | PF00085 | ||||||||
| Pfam klan | CL0172 | ||||||||
| InterPro | IPR013766 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00172 | ||||||||
| SCOP | 3trx | ||||||||
| Superfamilija | 3trx | ||||||||
| CDD | cd01659 | ||||||||
| |||||||||
Tioredoksinski sklop je proteinsko savijanje koje se često javlja u enzimima koji katalizuju formiranje disulfidne veze i izomerizaciju. Sklop nosi ime po kanoničkom primeru proteina sa ovim motivom, tioredoksinu. Ovaj sklop se javlja kod prokariotskih i eukariotskih proteina. Tioredoksinski sklop je primer alpa/beta proteinskog savijanja koji ima oksidoreduktaznu aktivnost. On ima prostornu topologiju koja se sastoji od četvorolančane antiparalelne beta ravni smeštene između tri alfa heliksa.
Konzervacija sekvence[uredi | uredi kod]
Uprkos varijabilnosti sekvenci u mnogim regionima sklopa, tioredoksinski proteini imaju zajedničku sekvencu aktivnog mesta sa dva reaktivna cisteinska ostatka: Cys-X-Y-Cys, gde su X i Y obično hidrofobne aminokiseline. Redukovana forma proteina sadrži dve slobodne tiolne grupe na cisteinskim ostacima, dok oksidovana forma sadrži disulfidnu vezu između njih.
Primeri[uredi | uredi kod]
Ljudski proteini sa ovim domenom su :
- DNAJC10
- ERP70
- GLRX3
- P4HB; P5; PDIA2; PDIA3; PDIA4; PDIA5; PDIA6; PDILT
- QSOX1; QSOX2
- STRF8
- TXN; TXN2; TXNDC1; TXNDC10; TXNDC11; TXNDC13; TXNDC14; TXNDC15; TXNDC16; TXNDC2; TXNDC3; TXNDC4; TXNDC5; TXNDC6; TXNDC8; TXNL1; TXNL3
Literatura[uredi | uredi kod]
- Creighton TE. (2000). Protein folding coupled to disulphide-bond formation. In Mechanisms of Protein Folding 2nd ed. Editor RH Pain. Oxford University Press.
Spoljašnje veze[uredi | uredi kod]
- SCOP thioredoxin superfamily Arhivirano 2011-05-16 na Wayback Machine-u
- CATH glutaredoxin topology Arhivirano 2007-03-12 na Wayback Machine-u