Dihidrouridin

Izvor: Wikipedia
Dihidrouridin
Dihydrouridine.svg
IUPAC ime
Drugi nazivi 3,4-dihidrouridin
3,4,5,6-tetrahidrouridin
5,6-dihidrouridin
Identifikacija
CAS registarski broj 5627-05-4
PubChem[1][2] 94312
Jmol-3D slike Slika 1
Svojstva
Molekulska formula C9H14N2O6
Molarna masa 246,217 g/mol

 YesY (šta je ovo?)   (verifikuj)

Ukoliko nije drugačije napomenuto, podaci se odnose na standardno stanje (25 °C, 100 kPa) materijala

Infobox references

Dihidrouridin (D, DHU, ili UH2) je zasićeni pirimidin koji se može formirati saturacijom uridina. Dihidrouridin se javlja u tRNK i rRNK molekulima kao nukleozid. Odgovarajuća nukleobaza je 5,6-dihidrouracil.

Zbog njegove neplanarnosti, Dihidrouridin poremećuje interakcije stekovanja u heliksima i destabilizuje RNK strukturu. Dihidrouridin stabilizuje C2’-endo konformaciju šećera, koja je fleksibilnija od C3’-endo konformacije, i taj efekat se propagira na susedni 5’ ostatak. Dok pseudouridin i 2’-O-metilacije stabilizuju lokalnu RNK strukturu, D čini suprotno.[3]

tRNK organizama koji rastu na niskim temperaturama (psihrofili) imaju visoke nivoe 5,6-dihidrouridina (40-70% iznad proseka), što daje neophodnu lokalnu fleksibilnost tRNK na temperaturama ispod tačke smrzavanja.[4]

Reference[uredi - уреди]

  1. Li Q, Cheng T, Wang Y, Bryant SH (2010). "PubChem as a public resource for drug discovery.". Drug Discov Today 15 (23-24): 1052–7. doi:10.1016/j.drudis.2010.10.003. PMID 20970519.  edit
  2. Evan E. Bolton, Yanli Wang, Paul A. Thiessen, Stephen H. Bryant (2008). "Chapter 12 PubChem: Integrated Platform of Small Molecules and Biological Activities". Annual Reports in Computational Chemistry 4: 217–241. doi:10.1016/S1574-1400(08)00012-1. 
  3. Dalluge JJ, Hashizume T, Sopchik AE, McCloskey JA, Davis DR. (Mar 15 1996). "Conformational flexibility in RNA: the role of dihydrouridine". Nucleic Acids Res 24 (6): 1073–1079. doi:10.1093/nar/24.6.1073. PMC 145759. PMID 8604341. 
  4. Dalluge JJ, Hamamoto T, Horikoshi K, Morita RY, Stetter KO, and McCloskey JA (March 1 1997). "Posttranscriptional modification of tRNA in psychrophilic bacteria". J Bacteriol 179 (6): 1918–1923. PMC 178914. PMID 9068636. 

Vidi još[uredi - уреди]

Spoljašnje veze[uredi - уреди]