Ponavljanje bogato leucinom

Izvor: Wikipedia
2bnh topview.png
Primer proteina sa ponavljanjem bogatim leucinom, svinjski inhibitor ribonukleaze
Identifikatori
Simbol LRR_1
Pfam PF00560
Pfam klan CL0022
InterPro IPR001611
SCOP 2bnh
Superfamilija 2bnh
OPM protein 1xwd
Varijanta ponavljanja bogatog leucinom
PDB 1lrv EBI.jpg
Varijanta ponavljanja bogatog leucinom
Identifikatori
Simbol LRV
Pfam PF01816
Pfam klan CL0020
InterPro IPR004830
SCOP 1lrv
Superfamilija 1lrv

Ponavljanje bogato leucinom (LRR) je proteinski strukturni motiv koji formira strukturu α/β potkovice.[1][2] On se sastoji od ponavljanja koja su 20–30 aminokiselina duga, i koja su obično bogata u hidrofobnoj aminokiselini leucinu. Tipično, svaka jedinica ponavljanja ima beta lanac-okret-alfa heliks strukturu. Domen formiran od mnogih takvih ponavljanja ima oblik potkovice sa unutrašnjom paralelnom beta ravni i spoljašnjim nizom heliksa. Jedno lice beta ravni i jedna strana niza heliksa su izloženi rastvaraču i stoga su bogati u hidrofilnim ostacima. Region između heliksa i ravni je proteinska hidrofobna osnova i čvrsto je sterično pakovana leucinskim ostacima.

Ponavljanja bogato leucinom često učestvuju u formiranju međuproteinskih interakcija.[3][4]

Vidi još[uredi - уреди]

Reference[uredi - уреди]

  1. Kobe B, Deisenhofer J (October 1994). "The leucine-rich repeat: a versatile binding motif". Trends Biochem. Sci. 19 (10): 415–21. doi:10.1016/0968-0004(94)90090-6. PMID 7817399. 
  2. Enkhbayar P, Kamiya M, Osaki M, Matsumoto T, Matsushima N (February 2004). "Structural principles of leucine-rich repeat (LRR) proteins". Proteins 54 (3): 394–403. doi:10.1002/prot.10605. PMID 14747988. 
  3. Kobe B, Kajava AV (December 2001). "The leucine-rich repeat as a protein recognition motif". Curr. Opin. Struct. Biol. 11 (6): 725–32. doi:10.1016/S0959-440X(01)00266-4. PMID 11751054. 
  4. Gay NJ, Packman LC, Weldon MA, Barna JC (October 1991). "A leucine-rich repeat peptide derived from the Drosophila Toll receptor forms extended filaments with a beta-sheet structure". FEBS Lett. 291 (1): 87–91. doi:10.1016/0014-5793(91)81110-T. PMID 1657640. 


Literatura[uredi - уреди]

Spoljašnje veze[uredi - уреди]