InChI
Internacionalni hemijski identifikator (-{InChI}-) je tekstualni identifikator hemijskih supstanci. On je dizajniran da bude standard kodiranja molekulske informacije koji je jednostavan za čitanje, i istovremeno prikladan za pretragu informacija u bazama podataka. Razvile su ga je organizacije IUPAC (eng. International Union of Pure and Applied Chemistry) i NIST (eng. National Institute of Standards and Technology) u toku 2000-2005. Format i algoritmi su nezaštićeni, i implementirani su u računarskim programima koji su slobodno dostupni pod LGPL licencom otvorenog koda. Termin -{InChI}- je trgovinska oznaka IUPAC organizacije.[1]
Sadržaj/Садржај |
[uredi - уреди] Pregled
Ovi identifikatori opisuju hemijske supstance u vidu informacionih slojeva — atomi i hemijske veze, tautomerska informacija, izotopska informacija, stereo-hemija, jonizacija. Svi slojevi nisu uvek neophodni, na primer, tautomerski sloj se može izostaviti kad ta je vrsta informacije nevažna.
-{InChI}- identifikatori se razlikuje od CAS brojeva u tri pogleda:
- oni su nezaštićeni,
- oni se mogu formirati na bazi hemijske strukture,
- najveći deo -{InChI}- identifikatora se može čitati (uz malo prakse).
InChI identifikatori se mogu smatrati generalnom I veoma formalnom verzijom IUPAC imena. Oni mogu sadržati veći informacioni sadržaj nego jednostavnija SMILES notacija. Poput kanoničkih SMILES oni su jedinstveni nizovi znakova, i prikladni su za upotrebu u bazama podataka. 3D koordinate atoma nisu deo -{InChI}- formata.
InChI algoritam pretvara strukturnu informaciju u jedinstveni -{InChI}- identifikator u tri stepena: normalizacija (odstranjivanje nepotrebnih podataka), kanonizacija (stvaranje jedinstvene numeričke etikete atoma), i formiranje niza znakova.
-{InChIKey}- je kaširani -{InChI}- identifikator sa fiksnom dužinom od 25 znakova. -{InChIKey}- specifikacija je objavljena u Septembru 2007. godine da bi se omogućila Veb pretraživanja hemijskih jedinjenja, pošto je to bilo problematično koristeći -{InChI}-.[2]
[uredi - уреди] Primeri
| -{CH3CH2OH}- etanol |
-{InChI=1/C2H6O/c1-2-3/h3H,2H2,1H3}- |
 L-askorbinska kiselina |
-{InChI=1/C6H8O6/c7-1-2(8)5-3(9)4(10)6(11)12-5/h2,5,7-10H,1H2/t2-,5+/m0/s1}- |
[uredi - уреди] Vidi takođe
[uredi - уреди] Literatura
- ↑ McNaught, Alan. "The IUPAC International Chemical Identifier:InChl", Chemistry International, IUPAC, 2006.
- ↑ The IUPAC International Chemical Identifier (InChI). IUPAC (5 September 2007).
[uredi - уреди] Eksterni linkovi
[uredi - уреди] = Dokumentacija i prezentacije
=
- IUPAC InChI lokacija
- Neslužbena InChI FAQ
- InChI tehnička uputstvaPDF (335 KB)
- Opis algoritma kanonizacije
- Googling for InChIs W3C prezentacija
- The Semantic Chemical Web: GoogleInChI and other Mashups, Google Tech Talk by Peter Murray-Rust, 13 Sept 2006
- IUPAC InChI, Google Tech Talk by Steve Heller and Steve Stein, 2 November 2006
[uredi - уреди] Softver i usluge
- NCI/CADD Chemical Identifier Resolver, Generiše i pretvara -{InChI/InChIKeys}- i mnoge druge hemijske identifikatore
- Generate InChI, Interaktivna služba na Univerzitetu Kembridža
- Search Google for molecules, Generiše -{InChI}- iz interaktivno nacrtanih molekula, i pretražuje Google. Javascript osposobljen Veb pretraživač je potreban
- ChemSketch, Besplatan program za crtanje hemijskih struktura sa ulazom i izlazom u -{InCHI}- formatu
- PubChem
- ChemSpider Services
- MarvinSketch ChemAxon
- BKchem
